「牧養事工部」係教會「雙軌十部」組織中事工軌的一部，主要定位在於教會門徒之全人關懷，也對還沒進入團契的信徒舉辦各類活動或成長課程，希冀是信徒更加體驗教會群體之生活；主要包括：教牧輔導中心、禱告關懷、探訪關懷、新朋友關懷、喪葬關懷、愛心救助關懷、醫療諮詢關懷、全職同工退休關懷以及針對跨團契之需要而舉辦的全教會活動等事工。